Das anfallende Abwasser auf dem Gebiet der Gemeinde wird in drei verschiedenen Abwasserreinigungsanlagen verarbeitet. Im Talgebiet werden die Abwasser in die ARA Sargans oder in die ARA Seez geleitet. 

ARA Sargans
Die ARA Sargans und ARA Wartau arbeiten seit 2004 eng zusammen. Gemeinsam verfolgen sie das gleiche Ziel, täglich das anfallende Abwasser zu reinigen, damit es so sauber wie möglich wieder dem Wasserkreislauf zurückgegeben werden kann.

Der Verwaltungsrat des Abwasserverbandes Saar und der Gemeinderat der Politischen Gemeinde Wartau haben im Jahr 2004 vereinbart, eine gemeinsame Betriebsleitung einzusetzen. Diese Zusammenarbeit ermöglicht einen optimalen Einsatz der betrieblichen und der personellen Ressourcen.

ARA Seez
Die Gemeinden Flums, Mels, Quarten und Walenstadt haben sich unter der Bezeichnung Abwasserverband Seeztal zu einem Zweckverband zusammengeschlossen.

Der Abwasserverband Seeztal bezweckt den Bau, Betrieb und Unterhalt der zentralen Ab­wasserreinigungsanlagen, der Hauptsammelkanäle inkl. Hochwasserent­lastungen zwischen der zentralen Abwasserreinigungsanlagen und den relevanten Sonderbauwerken sowie der relevanten Sonderbauwerke (Regenüberlaufbecken, Pumpwerke) in den Einzugsgebieten der ganzen Gemeinde Flums, der Gemeinde Mels (Teileinzugsgebiet Seez), des Ge­biets Flumserberge der Gemeinde Quarten und der ganzen Gemeinde Walenstadt.